Желудочно-кишечный тракт человека и животных является естественной средой обитания микроорганизмов. Особенно их много в нижнем отделе толстой кишки. Число микроорганизмов в толстой кишке позвоночных составляет 1010–1011 на 1 г кишечного содержимого.

В тонкой кишке их значительно меньше благодаря бактерицидности желудочного сока, перистальтике и, вероятно, эндогенным антимикробным факторам тонкой кишки, хотя может достигать у человека 108. В верхнем и среднем отделах тонкой кишки есть только небольшие популяции: грамположительные факультативные аэробы, небольшое количество анаэробов, дрожжей и грибов. В дистальных отделах тонкой кишки (в области илеоцекальной заслонки) состав ''микробного спектра'' занимает промежуточное положение между микрофлорой проксимальных отделов тонкой и толстой кишки. Нижняя часть подвздошной кишки заселена такими же микроорганизмами, что и толстая кишка, хотя в меньшем количестве.

Более доступна исследованию микрофлора фекалий, которая фактически является флорой дистального отдела толстой кишки. В фекалиях при микроскопии обнаруживают множество бактериальных клеток, из которых примерно 10% может размножаться на искусственных питательных средах.

 

Анаэробные бактерии

Аэробные и факультативные бактерии

виды Bacteroides (особенно группы B.fragilis)

Escherichia coli

виды Prevotella

виды Enterobacter, Citrobacter, Klebsiella, Proteus, Providencia, Pseudomonas, Alcaligenes

виды Veillonella

бациллы (В. subtilis, В. brevis и др.)

лактобациллы (L. acidopliilus, L. brevis и др.)

лактобациллы

клостридии (C. Perfringens, С. Tetani, C. botulinum, C. Sporogenes и др.)

энтерококки

виды Peptococcus и Peptosreptococcus

дифтероиды

виды Actinomyces

плесневые грибы и виды Candida

 

Медицинская микробиология/ под ред. Покровского В. И., Поздеева О. К.